Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CRBNQ96SW2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CRBNQ96SW2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms