Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CICQ96RK0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CICQ96RK0 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms