Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMTK3Q96Q04 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMTK3Q96Q04 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms