Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CCDC43Q96MW1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms