Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCMH1Q96GD3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SCMH1Q96GD3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms