Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC35A4Q96G79 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC35A4Q96G79 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms