Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
NXNL1Q96CM4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
NXNL1Q96CM4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms