Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EAF2Q96CJ1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms