Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MED12Q93074 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MED12Q93074 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED12Q93074 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED12Q93074 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED12Q93074 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED12Q93074 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED12Q93074 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED12Q93074 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED12Q93074 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED12Q93074 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED12Q93074 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED12Q93074 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED12Q93074 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED12Q93074 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED12Q93074 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED12Q93074 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED12Q93074 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED12Q93074 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MED12Q93074 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED12Q93074 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED12Q93074 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED12Q93074 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED12Q93074 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED12Q93074 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED12Q93074 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED12Q93074 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED12Q93074 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED12Q93074 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED12Q93074 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MED12Q93074 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED12Q93074 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED12Q93074 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED12Q93074 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED12Q93074 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED12Q93074 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MED12Q93074 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED12Q93074 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED12Q93074 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED12Q93074 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED12Q93074 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED12Q93074 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED12Q93074 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED12Q93074 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED12Q93074 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED12Q93074 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED12Q93074 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MED12Q93074 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms