Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PHF3Q92576 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms