Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DNAAF4Q8WXU2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DNAAF4Q8WXU2 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms