Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
APOBEC4Q8WW27 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms