Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC107Q8WV48 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms