Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC12Q8WUD4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms