Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH4

NUP37, Nucleoporin Nup37, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP37Q8NFH4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NUP37Q8NFH4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms