Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHST4Q8NCG5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHST4Q8NCG5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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