Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ZIC4Q8N9L1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ZIC4Q8N9L1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms