Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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TMCO5AQ8N6Q1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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TMCO5AQ8N6Q1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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TMCO5AQ8N6Q1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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TMCO5AQ8N6Q1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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TMCO5AQ8N6Q1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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TMCO5AQ8N6Q1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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TMCO5AQ8N6Q1 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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TMCO5AQ8N6Q1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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TMCO5AQ8N6Q1 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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TMCO5AQ8N6Q1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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TMCO5AQ8N6Q1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TMCO5AQ8N6Q1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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