Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPAP2Q8IXW5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPAP2Q8IXW5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms