Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
WDR53Q7Z5U6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
WDR53Q7Z5U6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms