Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT27Q7Z3Y8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT27Q7Z3Y8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms