Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TCF23Q7RTU1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms