Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTF1AQ7RTS3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTF1AQ7RTS3 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms