Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CHMP1BQ7LBR1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms