Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CASC2Q6XLA1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms