Protein–RNA interactions for Protein: Q6ISB3

GRHL2, Grainyhead-like protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL2Q6ISB3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GRHL2Q6ISB3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRHL2Q6ISB3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRHL2Q6ISB3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRHL2Q6ISB3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRHL2Q6ISB3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRHL2Q6ISB3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRHL2Q6ISB3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRHL2Q6ISB3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRHL2Q6ISB3 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRHL2Q6ISB3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRHL2Q6ISB3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRHL2Q6ISB3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRHL2Q6ISB3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GRHL2Q6ISB3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRHL2Q6ISB3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRHL2Q6ISB3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GRHL2Q6ISB3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GRHL2Q6ISB3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRHL2Q6ISB3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRHL2Q6ISB3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRHL2Q6ISB3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRHL2Q6ISB3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRHL2Q6ISB3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRHL2Q6ISB3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GRHL2Q6ISB3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRHL2Q6ISB3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GRHL2Q6ISB3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms