Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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RTL6Q6ICC9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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RTL6Q6ICC9 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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RTL6Q6ICC9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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RTL6Q6ICC9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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RTL6Q6ICC9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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RTL6Q6ICC9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RTL6Q6ICC9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RTL6Q6ICC9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RTL6Q6ICC9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RTL6Q6ICC9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RTL6Q6ICC9 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RTL6Q6ICC9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RTL6Q6ICC9 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RTL6Q6ICC9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RTL6Q6ICC9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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RTL6Q6ICC9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RTL6Q6ICC9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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