Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC102BQ68D86 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms