Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SHEQ5VZ18 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms