Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM208BQ5VWN6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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FAM208BQ5VWN6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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FAM208BQ5VWN6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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FAM208BQ5VWN6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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FAM208BQ5VWN6 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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FAM208BQ5VWN6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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FAM208BQ5VWN6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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FAM208BQ5VWN6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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FAM208BQ5VWN6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM208BQ5VWN6 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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