Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
C9orf135Q5VTT2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C9orf135Q5VTT2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms