Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PHYHD1Q5SRE7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PHYHD1Q5SRE7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms