Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PAN3Q58A45 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PAN3Q58A45 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms