Protein–RNA interactions for Protein: Q53LP3

SOWAHC, Ankyrin repeat domain-containing protein SOWAHC, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOWAHCQ53LP3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SOWAHCQ53LP3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms