Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RFTN2Q52LD8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms