Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CFAP100Q494V2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms