Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LETM2Q2VYF4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms