Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPHKAPQ2M3C7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPHKAPQ2M3C7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
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