Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC27Q2M243 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC27Q2M243 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms