Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
IMPG1Q17R60 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IMPG1Q17R60 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms