Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
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PDK4Q16654 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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PDK4Q16654 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PDK4Q16654 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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PDK4Q16654 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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PDK4Q16654 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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PDK4Q16654 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
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PDK4Q16654 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PDK4Q16654 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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