Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
LAMA4Q16363 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
LAMA4Q16363 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms