Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZIC1Q15915 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms