Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6AP1Q15904 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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