Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITSN1Q15811 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ITSN1Q15811 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
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