Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SKIV2LQ15477 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SKIV2LQ15477 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms