Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAM2Q15035 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TRAM2Q15035 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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