Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNIP1Q15025 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TNIP1Q15025 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TNIP1Q15025 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TNIP1Q15025 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TNIP1Q15025 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TNIP1Q15025 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNIP1Q15025 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNIP1Q15025 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNIP1Q15025 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNIP1Q15025 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNIP1Q15025 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNIP1Q15025 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNIP1Q15025 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNIP1Q15025 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNIP1Q15025 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNIP1Q15025 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TNIP1Q15025 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNIP1Q15025 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNIP1Q15025 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNIP1Q15025 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNIP1Q15025 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNIP1Q15025 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNIP1Q15025 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNIP1Q15025 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TNIP1Q15025 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNIP1Q15025 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TNIP1Q15025 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TNIP1Q15025 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms