Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PCLAFQ15004 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms