Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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ODF1Q14990 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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ODF1Q14990 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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ODF1Q14990 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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ODF1Q14990 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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ODF1Q14990 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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ODF1Q14990 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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ODF1Q14990 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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ODF1Q14990 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
ODF1Q14990 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
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